PCR förbättrar virusdiagnostik vid diarré hos unga kalvar i Norge

PCR-test är mycket bättre än snabbtest för att hitta bovint coronavirus och rotavirus hos kalvar med diarré, särskilt tidigt i sjukdomsförloppet. Veterinärer som tar prov inom tre dagar från diarréstart ökar chansen att få rätt diagnos och sätta in rätt åtgärder. Det här gör stor skillnad för att minska smittspridning och förbättra vården av unga kalvar.

Klinisk diarré hos unga kalvar är ett vanligt problem med betydande konsekvenser för djurvälfärd och produktionsförluster. Trots etablerade rutiner är kunskapen om optimal provtagning och diagnostik för att säkert identifiera bovin coronavirus (BCoV) och rotavirus begränsad, vilket utmanar behandling och smittskydd.

Studien undersökte 235 norska kalvar med akut diarré. Avföringsprover analyserades med realtids-PCR och snabbtest (POC) för bovint coronavirus och rotavirus, med syfte att jämföra diagnostiska metoder och undersöka provtagningsstrategi.

PCR upptäckte bovint coronavirus hos 140 av 235 kalvar (60 %) och rotavirus hos 123 av 235 kalvar (52 %). Samtidig infektion med båda virus påvisades hos 69 kalvar (29 %). Snabbtestet (POC) för rotavirus visade positivt resultat hos 97 av 235 kalvar (41 %), medan motsvarande test för bovint coronavirus var positivt hos 55 av 235 (23 %). När PCR användes som referensmetod erhölls en känslighet för rotavirus-snabbtestet på 70 % och för bovint coronavirus-snabbtestet 39 %. Specificitet för rotavirus-snabbtestet uppgick till 98 % och för coronavirus-testet till 100 %. Det framkom att provtagning tidigt i diarréförloppet ökade sannolikheten att identifiera virus. Virusdetektionen minskade markant efter dag 3 från diarrédebut: för BCoV från 81 % till 41 %, och för rotavirus från 77 % till 47 %. Nivåerna av virus (mätt som Ct-värde) var högst i början av diarré.

Resultaten visar att realtids-PCR är betydligt känsligare än snabbtest för påvisning av bovint coronavirus och rotavirus hos kalvar med diarré, särskilt i sjukdomens tidiga skede. Tidig provtagning är avgörande för att förbättra diagnostiken och ge säkrare smittspårning och behandlingsbeslut. Snabbtesterna har högt värde när positiva, men missar många infektioner och kan därför inte ersätta PCR, särskilt vid utredning av utbrott i besättningar. Resultaten är direkt kliniskt relevanta för veterinärer som hanterar kalvdiarré och visar vikten av både rätt prov och rätt timing vid virusdiagnostik.

Studie av Jørgensen et al., Norges miljø- og biovitenskapelige universitet, Veterinærinstituttet, och Norges veterinærhøgskole, publicerad i Acta Veterinaria Scandinavica. Fulltext: https://actavetscand.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13028-025-00822-9